1824 byggde orgelbyggaren P Z Strand ett enmanualigt orgelverk på elva stämmor till dåvarande ”Fattighuskyrkan” i Göteborg. 1877 byggde den danska firman Marcussen om och utökade orgeln till två manualer, pedal och 16 stämmor. Efter ännu en ombyggnad och pneumatisering på förtiotalet har nu orgeln fått ett nytt ansikte som starkt anknyter till de två orgelbyggarna på 1800-talet.
Första manualen består av pipmaterial från P Z Strand som kompletterats med felande pipor. Andra manualen har i huvudsak pipmaterial från Marcussen.
Orgeln i Mariakyrkan återinvigdes söndagen den 25 mars 2012.
| Man I | Man II | Ped |
| Borduna 16′ | Corni di basetto 8′ | Subbas 16′ |
| Principal 8′ | Rörflöjt 8′ | Violon 8′ |
| Flagfleut 8′ | Gamba 8′ | Basun 16′ (genomsl.) |
| Fugara 8′ | Flauto Amabile 8′ | |
| Octava 4′ | Piffaro 8′ fr. c | Normalkoppel |
| Rörfleut 4′ | Gemshorn 4′ | |
| Qvinta 3′ | ||
| Octava 2′ | ||
| Scharff III | ||
| Trumpet 8′ |
